Histopathology test workflow modeling in bounds of laboratory information systems

Abstract

Лабораторна інформаційна система як частина системи обміну інформації є головним елементом електронного обігу клінічних даних та зберігання медичної документації. Наразі лабораторна інформаційна система є основним ресурсом діагностичних даних для лікарів. Розробляючи таку систему для лабораторій, особливо генетичних, часто потрібно задовольняти потреби відділень тестування для диагностіки патологій та хірургічних дослідів. Також потрібно враховувати, що лабораторії, що проводять тести для диагностіки патологій, працюють з різними біоматеріалами, хірургічними зразками, вилученими з організму, рідин і тканин організму. Під час аналізу патологи використовують обладнання, яке може отримувати та надсилати дані тестування до шнформаційної системи. Мета цієї статті - побудувати модель бізнес-процесу тестування в лабораторіях патологічних досліджень у випадку гістопатологічного тестування. Розглянуто випадок використання панельних тестів з гістопатології, включаючи можливість інтеграції з лабораторним устаткуванням (інструментами), та побудувано математичну модель даних загального тестового бізнес-процесу, що використовується для розробки лабораторних інформаційних систем. В роботі наведена bpmn-діаграма гісторпатологічного тестування в загальному вигляді, а також формалізовано змінні, що описують математичну модель бізнес-процесу, стани системи і перехід з одного в інший. Синтезована модель може бути використана в процесі розробки лабораторних інформаційних систем. До побудованої моделі застосовано кінцевий автомат згідно з машиною Тьюринга, що проходить можливі стани системи, в яких вона може знаходитися в процесі гістопа- тологічного тестування. Розроблена в ротобі модель дозволяє здійснити попереднє налаштування та адаптацію бізнес-процесу до конкретних лабораторних потреб під час розробки лабораторної системи. Подальшим розвитком цієї моделі може стати синтез оптимізаційної моделі для ефективного використання ресурсів обладнання та реагентів у лабораторіях